Затем последовала картина «In a Land of Plenty», после чего Маккрори появилась в двух полнометражных фильмах: «Шарлотта Грей» и «Граф Монте-Кристо». В первом она исполнила роль Франсуазы, а во втором — Валентины де Вильфор, старшей дочери прокурора де Вильфора от первого брака, богатой наследницы, фактически сиделки при своём дедушке и возлюбленной друга главного героя Максимиллиана Морреля. Следующей её успешной ролью стало исполнение Барбары Вильерс в телефильме «Последний король».

После фильмов «Воспоминания неудачника», «Джейн Остин» и Казанова последовала небольшая роль в сериале «Жизнь как приговор». Съёмки проходили в Лос-Анджелесе, и Хелен жила там вместе со своим мужем Дэмиэном Льюсом, также снимавшимся в нём, и двумя детьми. Хелен прожила там с ним год «купаясь в бассейне в пижамных штанах и бикини, наслаждаясь общением с детьми».

Затем Хелен озвучила миссис Бин в мультфильме «Бесподобный мистер Фокс», снятом по мотивам одноимённой книге одноимённой книги Роальда Даля. Также Маккрори снялась в фильме 4.3.2.1., исполнив мать одной из главных героинь Джоанны.

Королева

Одна из самых известных работ Маккрори в кинематографе - роль супруги премьер-министра Великобритании Тони Блэра Шери Блэр в биографическом фильме «Королева». Роль Блэра исполнил Майкл Шин.

Картина повествует о первых семи днях после смерти леди Дианы. Премьер-министр Тони Блэр пытается убедить королеву, что нужно показать народу, что королевская семья сожалеет о случившимся, но Елизавета отказывается, уверенная, что главе государства не пристало показывать свои эмоции.

Предпремьерный показ картины состоялся 2 сентября 2006 года на Венецианском кинофестивале и только 15 сентября фильм вышел на широкие экраны Италии. 10 октября 2006 года состоялась премьера на территории США. На российские экраны фильм вышел 1 марта 2007 года. На производство картины было затрачено 15 миллионов долларов, а общемировые сборы составили около 123 миллионов долларов. Фильм является лауреатом премии BAFTA в категории «Лучший фильм». Помимо этого фильм был номинирован на «Оскар» как «лучший фильм».

Сама Хелен была номинирована на Премию Общества кинокритиков Лондона, но её обошла Эмили Блант. Мнения об игре Маккрори разделились. Катя Тарханова отметила, что «легче всех работать Хелен Маккрори в роли Чери Блэр. Ей не надо вымучивать отсутствующие манеры, и неплохая характерная актриса вдоволь повеселилась с вульгарной и наглой Чери». Хотя Маккрори и отвергает это. Она также снялась в продолжении кинофильма «Особые отношения», где исполнила ту же роль.

Гарри Поттер

Вторым наиболее известным фильмом с её участием является Гарри Поттер. Кастинг фильма «Гарри Поттер и Орден Феникса» стартовал в мае 2005 года, сразу же после того, как исполнитель главной роли в прошлых фильмах о Гарри Поттере, Дэниел Рэдклифф, объявил, что остаётся в проекте. Одной из важных задач для съёмочной стал выбор актрисы на роль Беллатрисы Лестрейндж. Уже в августе 2005 в Интернет и СМИ просочился слух, что роль исполнит Хелен. 2 февраля 2006 года эта информация была официально подтверждена, в том числе в газете надо=CBBC.