В это время сбежавший из карцера Уилл оставляет сигналы Беккету, сбрасывая тела убитых солдат в море. Джек обнаруживает его и сбрасывает самого, дав Уиллу свой компас. Тиа Далма спорит с Барбоссой, за что он заточает её в камере, открыв в разговоре с колдуньей, что она и есть Калипсо. Прибыв в Бухту Погибших Кораблей, Джек и Барбосса идут на встречу совета пиратов. Там Барбосса предлагает освобождение Калипсо из заточения в человеческом теле, но ему противятся другие бароны. Затем прибывает Элизабет и занимает место Сяо Фэня. Все капитаны кладут свои «песо» (пенсне, горлышко бутылки, деревянный кубок, игральную карту, вставной глаз и т. п.) на поднос, тем самым открывая совет пиратов. Кроме Джека Воробья, который скрыл свой «песо», и не стал класть его на поднос (Барбосса, однако сумел распознать какой именно «песо» имеется у Джека). Узнав о скором прибытии армады Беккета, пираты спорят, что им делать.

Некоторые предлагают оставаться в осаде в бухте, которая является настоящей цитаделью. Элизабет предлагает драться, и её поддерживает Джек. Барбосса отвечает, что согласно пиратскому Кодексу войну может объявить только Король Пиратов, что и подтверждает Хранитель Кодекса, капитан Тиг — отец Джека. Лорды начинают голосовать за Короля, но каждый, по-пиратски, голосует только сам за себя, кроме Джека, который неожиданно голосует за Элизабет, тем самым делая её Королём. Элизабет объявляет войну Ост-Индской Компании, и пиратские бароны вынуждены её поддержать. Брошенного в море Уилла подбирает корабль Беккета. Уилл утверждает, что может найти Бухту Погибших Кораблей с помощью компаса Джека, который указывает на то, что его владелец желает больше всего.

Утром армада Компании во главе с «Голландцем» прибывает к бухте, где её встречает флот пиратов. Беккет, Джонс и Уилл встречаются с Элизабет, Барбоссой, и Джеком на небольшой песчаной мели между флотами. Элизабет меняет Джека на Уилла, на что все согласны. На предложение сдаться Элизабет отвечает отказом. Барбоса нападает на Джека, но, пока что, не с целью убийства. Украв последний «песо» у Джека он выводит Тиа Далму из трюма корабля и совершает ритуал, освобождающий богиню, считая, что она поможет пиратам одолеть армаду Беккета. Но Калипсо зла на всех — и на Джонса, и на пиратов, которые её заточили. Она рассыпается в тысячу крабов и исчезает. Обеим сторонам дует благоприятный ветер, и Беккет отдаёт приказ: «Велите Джонсу никому пощады не давать. То-то он обрадуется!» С флагмана Беккета передают сигнал на «Голландец», Мёрсер велит готовить оружие. «Голландец» выплывает из рядов кораблей Компании, ему навстречу плывёт «Жемчужина». Каллипсо создаёт водоворот. Барбосса перед самым водоворотом сворачивает вправо, а морской дьявол ведёт «Голландец» прямо через водоворот. Начинается перестрелка между «Летучим Голландцем» и «Чёрной Жемчужиной».

Во время битвы Джек сбегает из трюма «Голландца» и забирает у солдат-охранников Компании сундук с сердцем Джонса, а Джонс убивает Мёрсера и снимает с его трупа ключ от сундука. Он намерен расквитаться со всеми. Тут он замечает Джека Воробья, который перепрыгивает на мачту «Летучего Голландца», и переносится туда же. Дэйви Джонс и Джек Воробей сражаются на рее, Джек отрубает Джонсу щупальце, на котором висит ключ, и роняет сундук с сердцем на палубу «Голландца». Оба корабля берут друг друга на абордаж, и закипает битва между экипажами. Уилл выбирает момент и предлагает Элизабет выйти за него замуж. Она соглашается и просит Барбоссу (как капитана корабля) поженить их. Хотя Барбосса и занят дракой с командой «Летучего Голландца» и солдатами Ост-Индской Торговой Компании, он женит их. Уилл попадает на корабль Джонса, где дерётся с отцом, который его не узнаёт. Джонс нападает на Уилла и смертельно ранит им же выкованной шпагой. Билл Тёрнер наконец вспоминает сына и нападает на Джонса, но тот отражает атаку и готовится убить и Тёрнера-старшего. Но вдруг капитан «Голландца» застывает — Джек Воробей пронзил сердце Джонса обломком шпаги, зажатым в руке Уилла. Джонс падает в водоворот, и за ним следует его корабль, но перед этим Джек и Элизабет прыгают с корабля на импровизированном парашюте, а Билл Тёрнер вырезает сердце сына, чтобы сохранить его в сундуке вместо сердца мёртвого капитана.

«Жемчужина» под командованием Джека прямым ходом идёт на флагман Беккета, который вооружился сотней пушек. Тут из-под воды всплывает «Голландец», целый и невредимый, а его экипажу возвращён человеческий облик, ведь теперь у корабля новый капитан. Беккет этого не знает и считает победу близкой… пока «Голландец» не разворачивается для атаки на него. Оба корабля заходят с боков флагмана и начинают обстрел. Беккет верный своему слову, данному Уиллу Тернеру "Что Уилл и Элизабет останутся невредимы"(А они находились на разных кораблях), говорит, что «это — деловой подход» и безропотно принимает полное уничтожения корабля, забыв о своих подчинённых. После уничтожения манёвра Беккета оба корабля идут на армаду компании, но она разворачивается и уходит. Все пираты ликуют, а Уилл говорит отцу, что тот свободен от рабства Джонса. Отец просит остаться на «Голландце», на что Уилл охотно назначает его рулевым.

Экипаж «Жемчужины» готовит лодку для Элизабет, на которой она плывёт к острову для встречи с мужем. Перед тем как сядет солнце, Уилл должен вернуться на свой корабль и не сможет выйти на твердую землю ещё десять лет. Он поручает Элизабет присматривать за его сердцем и уплывает делать то, что должен был делать Джонс — перевозить мертвые души в другой мир.

Джек идёт по причалу со своими двумя подружками с Тортуги, обещая им прокатиться на его корабле, вот только «Чёрная жемчужина» виднеется на горизонте. Джек берет парусную лодку и уплывает. На «Жемчужине» пятеро членов экипажа подходят к капитану Барбоссе и просят узнать их новую цель. Барбосса им рассказывает о фонтане вечной юности, который искал Понсе де Леон, но обнаруживает, что середина карты кем-то вырезана. Он закатывает глаза и проклинает Джека, который тем временем сидит в лодке и смотрит на карту, отплывая в своё новое путешествие.

Сцена после титров

После финальных титров действие переносится на десять лет вперёд, где Элизабет с сыном ждут Уилла на берегу. Они видят зелёную вспышку на закате, а значит, душа Уилла возвращается в наш мир. После чего показывается корабль, плывущий к Элизабет и сыну, а затем показывается сам Уилл, стоящий на корабле.

Роли дублировали

В ролях

Номинации и награды

Премия Оскар

• Лучшие визуальные эффекты
• Лучший грим

MTV Movie awards

• Лучший фильм года
• Лучшая актриса (Кира Найтли)
• Лучшая комедийная роль (Джонни Депп/Джек Воробей)