Разрушив башню, богатыри бросаются в погоню за царицей, но последняя уже на полдороге в Киев. Узнав о бегстве богатырей, она приказывает ворону уничтожить их. Создав монстров, ворон заставил Добрыню отстать от остальных. Помчавшись в бой, Добрыня падает в пропасть, также подстроенную вороном. После этого он, поменяв знаки, отправляет Алёшу в болото. Илья вместе с Бурушкой попадает ещё в одну ловушку ворона.

Очнувшись на острове, Добрыня набрёл на храм, где на него нападают ниндзя. Победив сэнсэя, на бой с Добрыней вышел Змей Горыныч. С его помощью Добрыня улетает с острова. Алёша тем временем выбирается из болота, где попадает в яму, а Юлия похищает монстр. Найдя дом монстра, Алёша побеждает его и уходит вместе с Моисеем и Юлием. Вскоре их находит Змей Горыныч и подбирает их. Вася, верблюд Добрыни, и Бурушка общими усилиями достают Илью из ямы. Мимо пролетает Горыныч и подбирает Илью. Поняв, что у них перегруз, они опускают Юлия и Моисея.

Царица и Князь тем временем уже прибыли в Киев. Сыграв свадьбу, царица стала собирать красавиц. С помощью своего зеркала она заставила их плакать. Во дворец прибыли жёны богатырей. Вырубив стражу, они заходят в покои. Царица позвала стражу, которая набросилась на девушек. Проиграв драку, Любава срывает с царицы её шляпу. Оказывается, что царица очень старая. Она приказала страже увести жён и Князя в темницу. Из тюрьмы им помогает выбраться Тихон.

Выбравшись в поле, Тихон, бабка и Князь, а также Алёнушка, Настасья и Любава встречаются с богатырями. Чтобы богатырей не околдовали, девушки завязывают им глаза. Тут приходят войска царицы, и начинается сражение. Сняв повязки с глаз, богатыри побеждают монстров. Тем временем кувшин наполнился, и царица убегает вместе с ним. В карете её ловят бабка и Тихон.

Посадив царицу в тюрьму, киевляне начали пировать. Царица сумела сбежать из тюрьмы и прибыла в храм. Полив дерево слезами, она стала поедать созревшие плоды. Увлёкшись этим занятием (хотя ворон предупреждал её не есть так много!), она превратилась в малыша. Ворон отнёс её в Киев — прямо к Князю.

В конце мультфильма мы видим, что маленькая царица сверкнула своими глазками. Фильм заканчивается весёлым смехом молодой девушки, постепенно превращающимся в зловещий смех царицы.

Даты премьер

• Флагификация|Азербайджан — 14 марта 2011.
• Флагификация|Казахстан — 30 декабря 2010
• Флагификация|Россия — 30 декабря 2010
• Флагификация|Украина — 30 декабря 2010.

Компьютерная игра. Отличия

По мультфильму была создана компьютерная игра. Некоторые отличия в сюжете:

• Главные отличия: Шамаханская царица (она была в другой одежде) хотела завладеть троном князя не ради слёз тысячи красавиц (так как она и без того была достаточно красива), а ради собственной власти. Также в отличие от мультфильма царице помогал не говорящий ворон, а помощник царицы.
• Также появились такие персонажи как Робин Гуд, Чёрт, двое говорящих волков (один из волков по голосу напоминал Копатыча из мультсериала «Смешарики»), Тугарин Змей (в игре он был уменьшен царицей и посажен в шкатулку (Алеша и Добрыня тоже попали в эту ловушку), правда сражаться с ним не придется), Колыван, Гонец, Забава.
• В отличие от предыдущих игр, где между этапами игры проигрывался отрывок из мультфильма, в этой игре между этапами показывается специально созданные видео-заставки, которые не являются отрывками из мультфильма.
• В игре Добрыню Никитича и Илью Муромца озвучивает один человек — Валерий Соловьёв, голосом которого говорили эти герои в предыдущих двух фильмах. В «Трёх богатырях», чтобы избежать повтора голосов, Муромца озвучивал Дмитрий Быковский. В игре же на озвучке сэкономили. Например, все женские роли в игре исполняла Елена Шульман.
• В игре был показан Колыван, в сцене, где Илья попадает в ад, там он мертвый, хотя он появился в продолжении цикла — мультфильме «Три богатыря на дальних берегах» (вероятно, он выбрался из ада в тот момент, когда черт, подумав, что грешники совершили массовый побег, убежал оповестить об этом).