Спустя шесть недель Хищника случайно освобождает игрок-Гаррисон, отключая камеру, чтобы пройти дальше. Используя имплантированное снаряжение, Хищник отправляется на поиски необходимого оборудования. В лабораториях он находит оборудование погибших сородичей и маску одного из них. Затем он пробивается в ангар, взрывает баки и запрыгивает на корпус подлетевшего десантного челнока (этот момент может увидеть игрок-Гаррисон). После того, как он проникает внутрь челнока, тот терпит крушение в горах неподалёку от Улья. Охваченный яростью Рыков отправляется следом.

Отбившись от полчищ Чужих, Хищник попадает на покинутый пост наблюдения, где посылает сигнал своему клану. Вскоре прибывает корабль клана, и Хищник получает недостающее оборудование и оружие обратно. Однако для возвращения в клан игроку-Хищнику нужно вернуть свою маску. Сначала он ищет Рыкова в зданиях комплекса Зет, где сталкивается и с Чужими, и солдатами Корпорации, пытающимися подготовить оборудование к вывозу Королевы. Затем вслед за Рыковым, облачившимся в экзоскелет, спускается вглубь Улья. Сам Рыков в этот момент пытается раззадорить Хищника, обращаясь к нему через маску.

Внутри Улья Хищник оказывается в одной яме с королевой ксеноморфов и убивает её. Затем возле выхода из Улья он находит ожидающего его Рыкова. Игрок сражается с ним, разрушает экзоскафандр и вырывает искусственный позвоночник Рыкова как трофей. Вернув свою маску, Хищник возвращается на корабль.

В финальном ролике (для этого нужно пройти все три кампании) «Верлок» отбывает с LV-1201, неся на борту команду морпехов. Отключается маскировка, и возникает корабль Хищников, летящий за «Верлоком».

Сюжет Чужого

Действие начинается в КПО (комплекс первичных операций). Майор Дуня доставляет крупный контейнер капитану Рихтеру. Рихтер пробует сканировать его, но контейнер не пропускает излучение. Во время процесса заправки корабля из-за вибрации контейнер падает на пол и открывается. Внутри — яйцо ксеноморфа, из которого появляется игрок-лицехват. Он покидает корабль через вентиляционные ходы и в поисках носителя обнаруживает спящего охранника. Вскоре игрок-грудолом прогрызает грудную клетку охранника. Игрок ищет мясо для того, чтобы вырасти, до тех пор пока не находит кошек в клетках. Наевшись, Чужой линяет и вырастает во взрослого трутня.

Трутень прорывается боем через КПО, выпуская других ксеноморфов. В тоннелях под комплексом игрок-трутень встречает Хищника и в бою наносит ему смертельные раны. Хищник активирует систему самоуничтожения, которая пробивает зияющую дыру в сточной системе КПО, открывая брешь в обороне КПО и позволяя Чужому сбежать. Сотни ксеноморфов позже проникают на базу через эту же дыру, начиная Инцидент.

Через шесть недель игрок-Чужой пробирается в капсулы, система безопасности которых была случайно отключена Гаррисоном. Игрок освобождает весь искусственный Улей и по пути убивает учёных, готовящихся внедрить Чужого в игрока-Хищника.

Эйзенберг использует прибытие морпехов чтобы инициировать проект по извлечению Королевы ксеноморфов из Улья. Солдаты-андроиды устанавливают взрывчатку по всей системе туннелей Улья, но игрок-Чужой обезвреживает взрывчатку и преследует Эйзенберга с похищенной Королевой до шахты огромного грузового лифта. Когда игрок выбирается на поверхность, он обнаруживает что челнок для эвакуации Эйзенберга с Королевой ксеноморфов ещё не прилетел. Затем он выводит из строя автоматы поддержки посадочной площадки, после чего челнок не может совершить посадку. Эйзенберг в панике вступает в бой с трутнем, но быстро проигрывает. В последующем ролике показано, что руки и ноги андроида Эйзенберга оторваны, а сам он замурован в стене внутри Улья.