Когда Беккет добрался до упавшего неизвестного вертолета, возле школы им. Уэйда, он видит раненного человека в темной форме. Когда Беккет перелез через окно, этого человека рубануло все ещё крутящейся вертушкой и он отлетел за крыши. Внешне броня того человека напоминала старую броню спецов SFOD-D «Дельты» из оригинальной F.E.A.R.. Из комикса-тизера, очевидно, что это Бреммер.

Весьма нежная и трогательная сцена должна была присутствовать в подземной лаборатории, во главе КЛОН. Альма жаловалась Беккету на ужасный холод и умоляла его обнять её. А после того как он ушёл, кричала, чтобы он вернулся и не бросал её.

Не было включено в оригинал в начале:

• Когда Женевьева вышла на связь, Гриффин сказал, что знает кто такой Вэнек.
• Гриффин велел Беккету просмотреть пленки на пульте охраны.
• После того как Гриффин велел подниматься Янковски по лестнице, он прибавил «И поспеши!» Редд по рации несколько раз повторил это слово и долго возмущался.
• Беккет не теряет сознание от взрывной волны. Он выходит на балкон и на него нападают телохранители Аристид. Один из них бьет его по голове ломом и Беккет теряет сознание.
• Во время операции медсестра предупреждает доктора Йорка, что у Беккета аритмия (просто в дубляже эта фраза прозвучала без перевода, хотя она есть).
• Оказавшись в больнице после операции, дверь у выхода была пригорожена столами, которые Беккет сдвигает, и через них на него нападает мерзость.
• Змеиный кулак сообщил почему «Армахем» напали на больницу и сообщил об Альме. После чего Стокс спрашивает откуда Кулак знает их.
• Вэнек заманил персонал больницы в ловушку, сообщив о выбросе и велев ждать его людей.
• Беккет идет по коридору и слышит дикие крики людей Вэнека. Когда он приходит на место из живых остается лишь один, который рассказывает Беккету почему работает на Вэнека.
• Найдя то место где его оперировали, Беккет не видел галлюцинаций, не было так же и мерзостей.
• Побывав в КТП, телестезическая аура Беккета дала галлюцинации по всей больнице. Кулак объяснил, что именно из-за ауры Альма видит Беккета.
• Перед смертью Редд произносит: «Чувак. Ну и отстой…»
• Стокс спрашивает Кулака, не хочет ли он, используя их команду, уничтожить Альму и улики против себя. В ответ Хэлфорд говорит что не хочет чтобы наступил «альмагедонн». Стокс называет его «удивительным человеком».
• После смерти Гриффина, должен был присутствовать небольшой видеоролик, из которого исходило, что Беккет и Стокс симпатизировали друг другу.
• Так же Альму заметил и Киган. Когда он говорит, что кого-то заметил, Стокс спрашивает: «Случайно не женщину?». На что Киган отвечает: «Она прекрасна».
• Солдаты Вэнека пытались задержать Аристид, когда она шла от Хэлфорда.

Имеются отличия в финале:

Беккет попадает в галлюцинацию Альмы и находит Кигана плачущим у дерева с качелью. Киган отбрасывал его от усилителя больше трех раз. Перед смертью Киган кричал, что «не позволит причинить ей боль».

• Стокс не упала от выстрела, а начала драться с Аристид, в то время, как ставни с Альмой и протагонистом закрываются.
• Перед галлюцинацией с беременной Альмой, Беккет видит, как растворяется его тело.
• Схватка с Киганом должна была быть более продолжительной.

Ссылки нет, но есть папка «snd»-«Voice» — там есть все скрытые диалоги. И по сравнению с бета-версий нет множества локаций.