По ходу игры Томми, Поли и Сэм становятся друзьями. У Поли зарождаются подозрения, что дон Сальери скрывает от них большу́ю часть денег, и он предлагает Сэму и Томми «небольшую халтурку», чтобы подзаработать. Они отказываются. Но после того, как Томми по поручению Сальери крадет из порта груз сигар, они с Поли, заглянув в коробки, узнают, что там были вовсе не сигары, а бриллианты. Подозрения, что Сальери скрывает от них часть денег, подтвердились, и Томми меняет решение. Поли и Томми решаются на ограбление выбранного заблаговременно банка. Ограбление проходит успешно. Поли и Том радуются триумфу; Поли мечтает открыть ресторанчик; как и Томми, он хочет отойти от криминальных дел.

На следующий день Том обнаруживает Поли убитым в своей квартире. Деньги исчезли. Вскоре позвонил Сэм, объяснив, что Сальери узнал об ограблении банка и приказал «убрать» обоих. Сэм предложил встретиться в музее, чтобы он смог помочь Тому. Лишь там Томми понял, что Сэм предал его, и Сальери знает о том, что он не убил проститутку и позволил Фрэнку бежать; ввиду «недееспособности» Томми, они были убиты позже другими людьми. После длительной перестрелки, Томми удается добраться до Сэма, который предупреждает его о серьёзных проблемах с его будущим. Простить слова по поводу смерти Поли Томасу не удаётся, и он хладнокровно убивает Сэма.

На этом завершается длительный рассказ детективу Норману, который Томми начал, сидя с ним в тихом кафе. Томми пообещал дать показания против Сальери, которого уже давно безуспешно пытается посадить за решетку детектив. В результате Томас становится членом программы по защите свидетелей: некоторое время он находится в безопасном месте, где подробно описывает свою жизнь и работу на Сальери, а затем, под другими именами, они с Сарой переезжают в Эмпайр-Бэй, надеясь на спокойную жизнь. Томми стал работать водителем в крупной компании. Многие из «семьи» Сальери, благодаря показаниям Томми, получили огромные сроки в тюрьме, а некоторых казнили.

Эпилог

Через много лет в Гринфилде (район Эмпайр-Бэя) 25 сентября 1951 года к дому пожилого Томаса Анджело подъедут два человека (Вито Скалетта и Джо Барбаро — главные герои Mafia 2). Томми, поливающий лужайку, обернётся на вопрос «Мистер Анджело?». Убедившись, что это именно тот, кто им нужен, один из них скажет: «Мистер Сальери передаёт вам поклон», а другой выстрелит в упор из обреза, после чего Томми останется лежать мертвым на испачканной кровью траве.

Игра завершается мыслями Томми:

Игровой процесс

Геймплей игры представлен в жанре шутера с видом от третьего лица; нередко в игре есть элементы приключенческой игры, когда необходимо исследовать локации и передвигаться по городу, а также элементы автомобильного симулятора (в частности, глава со спортивной гонкой, многочисленные преследования на автомобиле и размеренные поездки по Лост-Хэвену). В игре предусмотрено несколько режимов (см. ниже «Режимы игры»).

Управление в игре осуществляется от третьего лица при помощи клавиатуры и мыши, однако вид можно изменить, если герой сидит за рулем.

Интерфейc

Графический интерфейс отображает некоторые параметры, которые позволяют игроку контролировать состояние главного героя. Так, уровень здоровья персонажа показывается в левом нижнем углу экрана; когда этот параметр сводится к нулю, игра заканчивается — после этого придется проходить миссию с последней контрольной точки. Во время игры герой будет находить аптечки первой помощи и восстанавливать свое здоровье. Если героя сопровождают Поли, Сэм или какой-нибудь другой персонаж, индикаторы их здоровья появятся над индикатором здоровья главного героя.