Persona 3 Portable была выпущена как отдельная игра и как часть набора, включающего в себя футболку и настольный календарь. Отдельно игра распространялась за 6 279 йен (2009,28 руб.), тогда как набор (именовавшийся как Persona 3 Portable DX) за 8 495 йен (2718,4 руб.). В первый месяц после выхода было продано более 158 000 копий Persona 3 Portable. При выходе в Северной Америке в качестве бонуса за предзаказ Persona 3 Portable Atlus предложил кепку Дзюнпэя.

Persona 3 FES

ペルソナ3フェス — дополнительный диск к Persona 3, содержащий новые предметы/Персоны и т. д. к оригинальной игре, а также новый эпилог, в котором игрок играет за Айгис. Релиз FES в Японии состоялся 19 апреля 2007 года, как отдельной игрой, так и как «режиссёрской версией» Persona 3. Объединённое издание было издано в Северной Америке Atlus U.S.A. 22 апреля 2008 года, а в Европе — Koei 17 октября 2008 года. По словам создателя игры Кацуры Хасино аббревиатура «Fes» на самом деле сокращение от «festival». Игрокам оригинальной версии была предложена возможность переноса части данных из её сохраненной игры оригинальной версии, такой как компендиума, социальных показателей и вещи за максимальные социальные связи.

Кроме добавления новых предметов к основной игре, называемой в английском издании «Путешествие» (The Journey), а в японской — «Сюжет о себе», был включен новый эпилог «Ответ» (The Answer), или «Сюжет об Аэгис» в японском варианте. Основной геймплей «Ответа» похож на «Путешествие», но была убрана система социальных связей и героине не приходится посещать школу.

Persona 3 Portable

ペルソナ3 ポータブル — ремейк Persona 3 для PlayStation Portable, вышедший в Японии 1 ноября 2009 года, в США — 6 июля 2010 года, а в конце апреля 2011 года и в Европе. В этой версии появилась возможность выбрать пол главного героя. Выбор женского персонажа немного меняет часть игры: меняется дизайн первой Персоны героя, Орфея, на более женственный вариант; ассистентом Игоря в Бархатной комнате вместо Элизабет становится новый персонаж, ей эквивалентный, — Теодор. Также выбор пола влияет на некоторые детали социальных связей. Кроме появляния возможности игры за главную героиню, были добавлены два новых уровня сложности к старым трём. Persona 3 Portable включает в себя только сюжет оригинальной версии Persona 3; хотя в сюжет были внесены существенные изменения, зависящие от выбора персонажа.

В этой версии нашли отражания элементы, добавленные только в следующей за Persona 3 игре серии, Persona 4. В бою игрок может напрямую управлять всеми персонажами, либо использовать игровой искусственный интелект. Появилась возможность защищать союзников в бою, так что члены команды могут принимать на себя смертельные удары, предназначенные главному герою. Вне Тартара вместо непосредственного управления героем игрок просто перемещает курсор по экрану, взаимодействуя с персонажами или предметами. Звук в игре остался из оригинальной версии, но персонажей теперь нельзя видеть на текущей сцене, они появляются лишь как портреты. Кроме того, анимационные врезки из оригинальной Persona 3 были заменены на внутриигровые. Сёдзи Мэгуро создал музыку для новой Persona 3 Portable; некоторая фоновая музыка будет различаться, если выбран женский персонаж. Кроме того были добавлены камео персонажей Persona 4, в том числе Юкико Амаги, героя, которым можно управлять в Persona 4. Кроме того, в игре есть камео Винсента, звезды другой игры этой команды разработчиков — Catherine.