Прибыв в Хрустальные Пустоши, герои натыкаются на силы Клана. Оказывается, Клан ищет в Хрустальных Пустошах Книгу Д’Арга, величайшего чародея в истории Норкейн, благодаря которой можно призывать гаргулий. Генералы, не определившись, кому охранять столь важный артефакт, решают порвать её на пять частей и отдать друг другу. Позже они готовят войска для наступления на Шайкан, но после нескольких стычек воины Клана сдают позиции и Союз окончательно уничтожает их. Победив военачальников Клана и разрушив их лагеря, герои собирают книгу, и с помощью ледяной и огненной эссенции, добытых на западных и восточных островах, призывают гаргулий. Найтария говорит герою, что её разведчики, которых она послала на разведку в Поющее Стекло, не вернулись, тем самым намекая, что нужно их поискать (по сюжету, этого можно не делать, а сразу идти в Хрустальный Лес). Лаборатория Малакая находится в Хрустальном Лесу, куда и следуют герои.

Преследовать Малакая становится все труднее и труднее — на этот раз на пути Шайкан стоит Королевство, которое обустроилось обширным лагерем у подножия лаборатории, в качестве охраны труда Малакая, чтобы его труд не попал в нехорошие руки, но и сами они не знают, что Малакай может просто телепортироваться в свою лабораторию. Здесь герои находят последнюю эссенцию — каменную, с помощью которой они призывают Каменных Гаргулий. Именно благодаря Каменным Гаргульям Союз успешно атакует передовые опорные пункты Королевства. Но даже их помощи недостаточно: у самого подножия стоит крупный отряд, занимающий очень выгодную позицию в каньоне, окруженный башнями и гигантскими ледяными стенами, а с двух сторон воротами. На этот раз помощь приходит от Воина Теней, которого призывает Шайкан, с помощью Камня Теней. Тени, воюющие теперь уже на стороне главного героя, проникают на базу и дергают рубильники, открывающие ворота. Союз оперативными действиями уничтожает базу, а потом Шайкан проникают в саму лабораторию. Малакая там нет, но есть некие следы, дающие наводку, что он ушёл с свое самое секретное убежище, о котором не знал даже Ур — Стальной Берег. Убив гигантского стража и разгадав загадку, герои проследовали в портал.

Опасения Ура подтвердились: Малакай вернулся к исследованиям, и теперь уже весь Стальной Берег кишит Маларами — мерзкими творениями Малакая, отдали похожими на пауков, отчасти из-за характерного звука. Воин Теней в последний раз помогает Шайкан — он дает герою семерых Разорителей, Теней, способных вмиг уничтожать здания, с помощью которых можно сокрушить Черные Башни, наносящие колоссальные урон всем противникам. Перебив большую часть стражи. герои пытались догнать Малакая, который в конце концов загнал их в ловушку: чтобы подобраться к самому Малакаю, необходимо разрушить 5 кровавых алтарей, но уничтожив один алтарь Шайкан освобождает олицетворение одного из своих спутников, обладующее своими уникальными способностями. Уничтожив их, а позже проследовав по лучам пентаграммы, герои все-таки добираются до Малакая и убивают его.

С большими усилиями, но Малакай повержен, Эо вновь спасено, и как говорит Айлия из Освобождающей Игры SpellForce 2: «Мы в неоплатном долгу, как когда-то перед Курьером Души (так назовут главного героя, он появится в аддоне Dragon Storm, но немного в другом обличье)».

История Войн Теней заканчивается, начинается мирное время, но даже сейчас слышны отголоски войны, которая не за горами. Эо ждет нового героя, а он идет навстречу своей судьбе. Дальнейшие события будут разворачиваться в аддоне SpellForce2: Dragon Storm.