Выбравшись на поверхность, он попадает на склад, где один инженер рассказывает ему о неком грузе, который Уитли собирается отправить на материк. Джон понимает, что груз — инфекция. Найдя на складе взрывчатку, он отправляется на взлётно-посадочную полосу и выводит из строя самолёты, после этого он продолжает поиски Уитли.

Наконец Блейку удаётся догнать полковника на испытательном полигоне, где выясняется, что Уитли заражён, причём выведенным в лабораториях более огнеупорным штаммом вируса. Блейк в ходе преследования попадает на место падения НЛО, откуда и начинались события фильма. Уитли превращается в огромную гидру. Прилетает вертолёт и подбирает Блейка. Капитан, встав за пулемет на борту, расстреливает бочки с горючим, уничтожает чудовище, устраняя очаг инфекции.

Основные персонажи

• Джон Блэйк — протагонист, капитан ВМС США, командир отряда «Бета».
• Уитли — полковник, руководящий операцией, впоследствии, антагонист. Ассимилирован главным «Нечто» в лаборатории, убит Блэйком.
• Пирс — командир отряда «Альфа», покончил с собой в метеостанции, почувствовав собственное заражение.
• Фарадей - руководитель исследований "Нечто". Спасен Блэйком, однако впоследствии был убит Уитли из-за отказа сотрудничать.
• МакРиди — пилот, в финале подбирает Блэйка, и помогает ему уничтожить Уитли. Так же в первой миссии можно найти аудиозапись с его голосом.

Противники

• Маленькие твари — небольшие сгустки инфекции. Не слишком опасны, если встречаются по одному. Некоторые из них разбрызгивают вокруг жидкость.
• Большие твари — инфекция, захватившая какое-либо животное или человека, со временем обезображивает своего хозяина. Более она не нуждается в том, чтобы маскироваться и становится крайне опасной. Очень живучи. Многие из них очень быстры, некоторые могут отделять от себя части, становящиеся отдельными живыми организмами.
• Огромные твари — несколько раз в игре встречаются монстры, не способные передвигаться. Тем не менее, они наносят большие повреждения игроку, так как встречаются в замкнутых пространствах, из которых нельзя уйти, не уничтожив существо.
• Заражённые — напарники Блейка, превращающиеся в «нечто» после укоренения инфекции. Как правило, они ведут себя как обычные люди, но внезапно у них отрываются руки и голова, на месте которых возникают клешни и пасть. После процесса превращения они становятся, по сути "Большими тварями". Но если вовремя обнаружить превращение, то можно без потерь уничтожить зараженного.
• Солдаты — обыкновенные люди. Солдаты не слишком умны, и довольно медлительны, но если попасться под их прицел, то они могут довольно быстро убить игрока.

Оружие

• Электрошокер — оружие ближнего боя. Не наносит цели повреждений, но на время выводит из строя и людей и инфекцию. Человек под воздействием электрошокера роняет свое оружие. Если использовать шокер несколько раз, противник умрет.

• Пистолет — оружие дальнего боя. Очень точное и удобное оружие при борьбе с мелкими породами «нечто» или точечных выстрелов в голову людям. Очень хорош для вооружения напарников. Есть автонаведение.

• Автомат — оружие, с которым игрок начинает и заканчивает игру. Самое распространенное и самое часто используемое оружие. Очень эффективно при борьбе со стаями мелких особей «нечто». Есть автонаведение.