Они объясняют Сэму, зачем прибыли – им нужны те самые очки, на которых отпечатались координаты месторасположения Мегатрона и куба. Однако добраться до куба им не удаётся, так как в дело вмешивается секретная служба, занимающаяся изучением всего инопланетного.

В конечном итоге Мегатрон пробуждается после длительного сна, а между десептиконами и автоботами происходит жестокая схватка, во время которой многие трансформеры погибают или получают травмы. Великую Искру уничтожает Сэм, поместив артефакт в грудь Мегатрона, что приводит к смерти и самого предводителя десептиконов.

В фильме «Трансформеры 2: Месть падших» автоботы во главе с Оптимусом Праймом вместе с военными сражаются с остатками десептиконов. Однако представитель президента Гелоуэй требует, чтобы автоботы покинули Землю, так как он считает, что после этого десептиконы перестанут совершать нападения на людей. Оптимус решает подчиниться, но не верит в то, что это успокоит десептиконов. Незадолго до появления этого требования один из десептиконов во время сражения предсказал Прайму скорое возвращение некоего Фоллена.

С помощью одного из уцелевших осколков Искры десептиконам удаётся вернуть к жизни Мегатрона. Вместе со своим хозяином, Фолленом, Мегатрон и другие десептиконы собираются запустить древний механизм, который должен уничтожить Солнце, однако для этого им нужна информация, которой владеет Сэм – именно у него сохранился второй осколок Искры.

Тем времени, Сэм, прикоснувшийся к осколку Великой Искры, начинает видеть странные символы, что его очень пугает. Сэма похищают десептиконы и сообщают ему, что извлекут нужную информацию непосредственно из его мозга. Его спасают вовремя подоспевшие Оптимус с Бамблби. Во время неравной битвы с десептиконами Оптимус погибает.

В это время на землю прибывает сам Фоллен и, уничтожив военную базу, подключается к компьютерной сети, требуя выдать ему Сэма Уитвики. Он угрожает, что в противном случае уничтожит всех.

С помощью очень древнего десептикона Джетфайера, перешедшего на сторону автоботов, Сэм узнаёт, что именно от него нужно десептиконам. Он находит место, где спрятан «Гаситель звёзд», а также ключ, с помощью которого устройство можно запустить, называемый Матрицей Лидерства. С помощью Матрицы Сэму удаётся воскресить Оптимуса, так как только Прайм может победить Фоллена, и в итоге Оптимусу это удаётся, однако Меготрон с некоторыми другими десептиконами скрывается.

Наконец, в третьем фильме раскрываются истинные замыслы Мегатрона – он рассчитывал на то, что Оптимус будет оживлён с помощью Матрицы Лидерства, и ему требовалось, чтобы лидер автоботов смог воскресить Сэнтинела Прайма. Сэнтинел ещё во время войны между автоботами и десептиконами перевёз на Луну колонны, необходимые для осуществления процесса соединения Земли и Кибертрона. Сэнтинел оказывается предателем, заключившим соглашение с Мегатроном.

При помощи шантажа десептиконы добиваются того, чтобы лидеры правительств Земли заставили автоботов покинуть планету. Автоботы соглашаются. Все они размещаются на корабле, который уничтожают десептиконы во время старта. После этого десептиконы устанавливают колонны в нужных им местах, чтобы переместить свою родную планету на орбиту Земли. Они собираются превратить землян в рабов, которые должны будут заняться восстановлением Кибертрона.

Через некоторое время выясняется, что автоботы не погибли, так как на корабль они так и не сели. Общими усилиями людям и автоботам удаётся предотвратить перемещение Кибертрона и выиграть жестокую битву.

Как сообщают разработчики фильма «Трансформеры 4», дата выхода которого в России назначена на 26 июня текущего года, в этом фильме будет рассказана история изобретателя Кейда и его дочери. В это время на Земле уже нет автоботов и десептиконов, так как они покинули Землю после событий третьего фильма, однако не всё так радужно, как можно показаться на первый взгляд…