Отдельное видео исполнения песни «Gave Up» вместе с Ричардом Патриком и Мэрилином Мэнсоном был снято в студии «Le Pig studios», названное так самим Резнором, в месте убийства Шэрон Тейт. Кроме того было снято концертное исполнение и включено в компиляцию Closure 1997 года. В конце 1992 года за Broken последовал мини-альбом ремиксов Fixed. Вместо тура в поддержку нового материала Резнор начинает жить и работать в Le Pig над материалом для следующего альбома, будучи свободным от ограничений лейбла.

The Downward Spiral (1994—1997)

Второй полноценный альбом Nine Inch Nails, The Downward Spiral, выходит в марте 1994 и сразу же попадает на второе место Billboard 200. Альбом до сих пор остаётся самым продаваемым релизом группы в США. Влияние на музыку оказали альбомы Low Дэвида Боуи и The Wall группы Pink Floyd. Музыка и лирика The Downward Spiral отображают ментальный прогресс протагониста, что является концепцией всей записи. Это был последний альбом Nine Inch Nails, который спродюсировал Флад. Его сотрудник Alan Moulder занялся сведением The Downward Spiral, что послужило началом его долголетней работы с группой. Альбом был записан в Le Pig Studios, студии в особняке, в котором банда Чарльза Мэнсона убила Шэрон Тейт, беременную жену режиссёра Романа Полански.

Две композиции с альбома были выпущены как коммерческие синглы, «March of the Pigs» и «Closer». «Piggy» и «Hurt» также попали в ротацию радиостанций, но так и не были выпущены для продажи. Клип на «Closer», снятый Марком Романеком, можно было часто увидеть на канале MTV. При этом канал сделал цензированную версию клипа, откуда были убраны некоторые сцены и вырезана ненормативная лексика. Все клипы с альбома составили видеоряд документального фильма Closure, в котором показаны главные события времён «Self Destruct Tour».

Отзывы музыкальных критиков в целом были благоприятными: в 2005 году альбом был поставлен на 25 место в списке «100 величайших альбомов, 1985—2005» журнала Spin, а в 2003 году Rolling Stone поместил на 200 строчку своего списка «500 величайших альбомов». После выхода The Downward Spiral Резнор выпустил альбом ремиксов, названный Further Down the Spiral, единственный неосновной релиз Nine Inch Nails, который был сертифицирован как золотой в США. Он содержит работу музыкантов Aphex Twin, продюсера Рика Рубина и гитариста Jane’s Addiction Дэйва Наварро, и других.

Кульминацией тура стало выступление на фестивале Woodstock '94. Участники группы, покрытые грязью, собрали самую большую толпу у сцены, а трансляцию посмотрели более 24 миллионов зрителей. Причиной успеха стало высокое качество исполнения и добавление эффектных визуальных элементов в шоу. Продюсерская деятельность Трента, его перфекционизм, а также алкогольная и наркотическая зависимости все дальше и дальше отодвигали дату выхода следующего альбома.

Во время гастролей Резнор продюсирует саундтрек к фильму Оливера Стоуна «Прирождённые убийцы» с помощью портативного Pro Tools в своем гостиничном номере. Сборник включает новую песню Nine Inch Nails «Burn», написанную специально для фильма. В 1996 году Трент пишет саундтрек и звуки для игры «Quake». В 1997 году он продюсирует саундтрек к фильму «Шоссе в никуда» режиссёра Дэвида Линча. Заглавным треком становится «The Perfect Drug», клип на который опять снимает Марк Романек. Претерпевший ремастеринг The Downward Spiral был переиздан на SACD и DVD-Audio в 2004 году.