• 2 Анафема флаг Италии (Карини, Италия)

: Поиски отца Витторио приводят 47 к особняку мафиозного дона Джузеппе Джулиани. 47 убивает дона, но отца Витторио увозят с собой русские.

• 3 Преследование в Петербурге флаг России (Санкт-Петербург)

: Теперь по договору с Агентством 47 должен выполнить для них несколько заданий. 47 должен убить экс-генерала КГБ, который должен приехать на встречу, где будет очень легко совершить убийство.

• 4 Встреча в парке Кирова флаг России (Санкт-Петербург,Россия)

: После убийства первого генерала, другие генералы стали очень напуганы и начали расследование; клиент хочет, чтобы они умерли все. Генерал Макаров и местный криминальный авторитет Игорь Кубаско встречаются в парке Кирова для того, чтобы обсудить охрану оставшихся в живых генералов. 47 нужно убить их обоих.

• 5 Подземная торпеда флаг России (Санкт-Петербург)

: Третий экс-КГБ генерал Михаил Бардаченко допрашивает заключённого по поводу убийств в военной штаб-квартире в районе Невского проспекта. 47 должен проникнуть в здание, убить Михаила Бардаченко, спасти заключённого (который оказывается агентом ЦРУ Смитом, «старым знакомым» 47 из прошлой игры «Codename 47») и убежать через канализацию.

• 6 Приглашение на вечеринку флаг России (Санкт-Петербург)

: Последний генерал — это генерал Владимир Зубков, который решил сбежать из России и по этому поводу находится в немецком консульстве. 47-го посылают на званый вечер в консульство с приказом убить Зубкова, а также выкрасть чемодан, содержащий систему управления ракетами. С той же целью в консульство был послан агент спецназа.

• 7 Вслед за Хаямото флаг Японии (Тацуно, Япония)

: Чтобы найти Масахиро Хаямото, главу известных Якудза Ямагути-Гуми, 47 должен убить его сына, Масахиро-младшего, и спрятать в его трупе GPS-передатчик, который позволит обнаружить убежище Хаямото-старшего.

• 8 Таинственная долинафлаг Японии (Кацуяма, Япония)

: Оказавшись в горной долине перед 47-м поставлена задача — добраться до ворот в другом конце долины. Но сделать это, не так то просто, как может показаться на первый взгляд. Долина тщательно охраняется, повсюду расположены башни дозора, а местность патрулируется. Единственная лазейка — подземный туннель, куда прибывают грузовики с припасами.

• 9 У Воротфлаг Японии (Кацуяма, Япония)

: После прохождения внешнего периметра охраны 47-й проникает внутрь и чтобы попасть в сам замок нужно найти и отключить генераторы питания сигнализаций.

• 10 Поединок с Сегуномфлаг Японии (Кацуяма, Япония)

: Замок тщательно охраняется — повсюду лазерные сигнализации и скрипящие полы, малейший шум — и жди неприятностей. В подвале хранится специальное устройство ракетного наведения, которое необходимо выкрасть. Сам Масахир Хаямото находится на самом верхнем этаже. Так же в замке находится и небезызвестная сексуальная красавица Лэй Линь, которая вновь рада помочь 47-му (хотя, на самом деле, помогать ей будет Сорок Седьмой).

• 11 Убийство в подвале флаг Малайзии (Куала-Лумпур, Малайзия)

: Клиент Агентства хочет, чтобы 47 отправился в Малайзию и выкрал программное обеспечение для защиты ракетных установок, которое продает некий хакер Чарли Сиджан. 47 проникает в цокольный этаж башен «Петронас» в Куала-Лумпуре, убивает Чарли, узнаёт, что это лишь его брат-близнец и отключает охранную систему лифтов, чтобы подняться на вершину одной из башен.