Группа участвовала в создании песни для фильма Фёдора Бондарчука «9 рота», но в фильм песня не попала. На основе материалов с съёмок фильма группа создала видеоклип к песне «Звезда» (2005 год).

Альбом «Шаман» вышел в апреле 2006 года. В него вошли 12 композиций, включая песню «Феникс», полностью написанную и исполненную Дмитрием Оганяном. Некоторые песни с альбома («Звезда», «Родина — фотография», «Падающая звезда», «Иллюзии») исполнялись с апреля 2005 года.

В 2007 году сайт официального фан-клуба был трансформирован в официальный сайт группы www.kukry.ru.

В декабре 2007 вышел новый альбом группы «XXX». Концерт-презентация состоялся в Московском СДК МАИ 15 февраля 2008 года.

В начале 2008 года группу покидает звукорежиссёр Станислав Майоров.

В 2009 году сменился барабанщик, вместо Романа Николаева пришёл Михаил Фомин

В 2010 год «Кукрыниксы» приняли участие в записи сборника «Соль — Наши музыкальные традиции». На первой части сборника «Кукрыниксы» записали песню «Чёрный ворон». Эта же песня была включена в новый альбом «Всадники света». На эту песню группа планирует снять клип.

7 сентября 2010 года состоялась презентация альбома «Всадники света».

24 сентября 2010 вышел совместный проект группы Кукрыниксы и американской певицы Stephanie Starr под названием «K Republic» выпустили альбом «All Those Things I Left Behind» (Всё, что я оставил позади. В роли названия выступил отрывок из песни "Вертикаль": "Тех, что нехотя бросал,/Там нет;/Всё, что я в себе спасал,/С ними".).

В 2010 году в группу пришёл ещё один гитарист Игорь Воронов .

В 2011 году вышла сольная работа Горшенева «Горшенев-Есенин», к которой с благодарностью отнеслись работники музея Сергея Есенина села Константиново.

30 марта 2012 года состоялся релиз альбома Myself. Он стал второй и завершающей частью дилогии "Вечное Сияние Чистого Разума".

Состав

• Алексей Горшенёв «Ягода» — гитара, вокал, бас, автор музыки и текстов.
• Дмитрий Гусев «Дима Гусев» — гитара, музыка, аранжировки
• Дмитрий Оганян «Вагон»  — бас-гитара, бэк-вокал, вокал
• Михаил Фомин  — ударные (2009-нв).
• Игорь Воронов — гитара (2010-нв).

Бывшие участники

• Александр Леонтьев — вокал, гитары, драм-машина, музыка, тексты (1996—2000).
• Леша Синицкий — ударные (1996—1997).
• Максим Войтов — ударные (1997—2000).
• Виктор Бастраков — гитара (2000—2002).
• Илья Леваков — ударные (2000—2002).
• Николай Левитский — ударные (2002).
• Роман Николаев — ударные (2002—2009).

Дискография

Студийные альбомы

• 1999 — «Кукрыниксы»
• 2002 — «Раскрашенная душа»
• 2004 — «Столкновение»
• 2004 — «Фаворит Солнца»
• 2006 — «Шаман»
• 2007 — «XXX»
• 2010 — «Всадники Света»
• 2012 — «Myself»

Сольные проекты

• 2012 — Горшенёв-Есенин «Душа поэта»
• 2013 — Горшенёв-Есенин «Смерть поэта»

Совместные проекты

• 2010 — K Republic «Last resort»
• 2010 — K Republic «All Those Things I Left Behind»

DVD

• «Столкновение. Live» (2004);
• «XХX» — концертный DVD бонус к альбому (2007);
• «Коллекция клипов. Том I» (2008);
• «Концерт в ДС „Юбилейный“. Санкт-Петербург. 29.03.08» (2008).

Видеоклипы

• Не беда (1998)
• По раскрашенной душе (2002)
• Знай (2004)
• Звезда (2005)
• Колдовство (2006)
• Клетка (2009)
• ЗЛО (2010)