В 1986 году перешёл в группу экс-вокалиста Sex Pistols Джона Лайдона Public Image Ltd, приняв участие в записи альбома Album. В 1989 году присоединился к Whitesnake, заменив Вивиана Кэмпбелла, а когда Адриан Ванденберг повредил запястье незадолго до начала записи альбома Slip of the Tongue, Вай исполнил все гитарные партии в этом альбоме. Вай также появился в альбоме Элиса Купера Hey Stoopid, играя вместе с Джо Сатриани в песне «Feed My Frankenstein».

1990-е и 2000-е

В 1990 году Вай выпустил хорошо принятый критикой сольный альбом Passion and Warfare. В 1990-х годы продолжает регулярно гастролировать, как с собственной группой, так совместно с Джо Сатриани и Билли Шихэном в серии туров G3.

Гитарная партия в песне «For the Love of God» стала № 29 в опросе читателей «100 величайших гитарных соло всех времён» в журнале Guitar World Magazine.

В 1994 году работал с Оззи Осборном, но только один трек («My Little Man») из совместных сессий попал на альбом Осборна Ozzmosis (имя Вая не упоминается в альбоме, а гитарные партии его сочинения исполнил Закк Уайлд). Другая песня, сочинённая совместно с Осборном, «Dyin' Day», появилась уже как инструментальный трек в альбоме Вая Fire Garden. В 1994 году Ваю присуждена премия Грэмми за исполнение песни Фрэнка Заппы «Sofa» с альбома «Zappa’s Universe».

Участниками группы Вая в 1990-е годы были барабанщик Майк Манджини, гитарист Майк Кенелли и басист Philip Bynoe.

В июле 2002 года выступил с Токийским симфоническим оркестром в Сантори Холл в Токио в рамках мировой премьеры концерта «Fire Strings», написанного для электрoгитары и оркестра с 100 инструментами японским композитором Итиро Нодайрой (Ichiro Nodaira).

В 2004 году некоторые из композиций Вая и оркестровых аранжировок, включая записанные ранее части, были исполнены в Нидерландах с Metropole Orchestra в серии концертов, названных «The Aching Hunger». В 2003 году барабанщик Джереми Колсон присоединился к группе Вая, заменив барабанщика Virgil Donati.

В феврале 2005 года совместно с классической гитаристкой Шэрон Исбин в парижском театре Шатле представил гитару Ibanez с двумя грифами (электрическим и классическим), названную The Blossom Suite. В 2006 году выступал в качестве специального гостя вместе с другими бывшими участниками группы Фрэнка Заппы, барабанщиком Терри Бозио, гитаристом-певцом Рэйем Уайтом и саксофонистом Наполеоном Мерфи Броком в рамках тура «Zappa Plays Zappa» во главе с Дуизиллом Заппой.

В 2007 году выпустил альбом Sound Theories был выпущен в 2007 году.

Видеоигры

Композиция «Juice» была использована для видеоигры «Formula One», которая вышла на PlayStation в 1996 году. Композиция «Erotic Nightmares» была использована как титульная музыка для меню видеоигры «WCW / NWO Revenge», которая вышла на Nintendo 64. Две песни появились в видеоигре «Grand Theft Auto: Vice City». Обе песни — «Yankee Rose» Дэвида Ли Рота и «God Blessed Video» группы «Alcatraz» — были включены в официальный саундтрек игры. В 2004 году Стив Вай появился в саундтреке к игре Halo 2 (выпущенной Bungie Studios на Xbox), исполнив хард-рок тему Halo, известную как Halo Theme (Mjolnir Mix). Кроме того, он исполнил композицию «Never Surrender». Позже Вай появился во втором томе саундтрека к игре, где он исполняет трек «Reclaimer».

В 2008 году композиции Стива Вая «For the Love of God» и «Halo Theme (Mjolnir Mix)» были представлены как загружаемые треки для игры Guitar Hero 3.