В 1891 году Семевский по инициативе Иннокентия Сибирякова предпринял путешествие по Сибири для знакомства с местными архивами. Помимо архивных данных его интересовало также современное положение рабочих на золотых приисках Якутии, и ему удалось собрать массу фактического материала для своего исследования «Рабочие на сибирских золотых промыслах», которое появилось на страницах «Русской мысли» в 1893 — 1894 годах и в окончательном виде в 1898 году. За эту работу учёный был удостоен Самаринской премии.

В 1890-х годах Семевский принимает участие в деятельности Исторического общества при Петербургском университете, созданного профессором Н. И. Кареевым, чьи заседания также проходили на историко-филологическом факультете, в них принимали участие А. С. Лаппо-Данилевский, И. В. Лучицкий, Н. П. Павлов-Сильванский, Е. В. Тарле, Б. Д. Греков. С 1894 по 1896 год Семевский был заместителем председателя этого общества.

Семевский — автор статей в ЭСБЕ о декабристах: И. Д. Якушкине, С. П. Трубецком, Н. И. Тургеневе, В. И. Штейнгале, а также о М. М. Сперанском, Н. А. Спешневе, Фурье и фурьеризме и т. д.

Василий Иванович — активный участник многочисленных обществ петербургской интеллигенции. С 1880 года он состоял членом Общества любителей российской словесности, с 1895 года — член Вольного экономического общества. С этого же года он стал секретарём отдела для содействия самообразованию в комитете педагогического музея военно-учебных заведений. Он был также членом правления Литературного фонда.

В 1892 году скоропостижно скончался старший брат Василия — Михаил. Близкие Василия Ивановича предполагали, что старейший исторический журнал «Русская старина» перейдёт по наследству ему, однако окружение Михаила Ивановича распорядилось иначе: журналом завладели иные люди. Правда, Василий к этому времени давно отдалился от консервативного предприятия своего брата и печатался исключительно в радикальных, народнических или либеральных изданиях.

Последние годы

С 1905 года его общественная деятельность ещё более активизируется. Он принимает участие в акциях протеста петербургской интеллигенции против репрессивных мер правительства. Как и другие участники депутаций к правительству накануне 9 января, он арестовывается и на две недели заключается в Петропавловскую крепость. С этого года он — председатель Комитета помощи освобождённым узникам Шлиссельбургкско крепости, чьи обращения совместно с Н. Ф. Анненским и В. Я. Богучарским он публиковал на страницах журнала «„Былое“», и член Комитета по оказанию помощи политссыльным.

К этому времени Семевский идеологически давно примкнул к либерально-народническому «Русскому богатству», много и охотно печатается в «Былом» и «Минувших годах» В. Я. Богучарского и П. Е. Щёголева — журналах, специализировавшихся на истории освободительного движения. В 1906 году он стал одним из создателей партии народных социалистов (иначе говоря, Трудовой народно-социалистической партии, «энесы» или просто «трудовики») и членом её ЦК.

С наступлением новой реакции «Былое» и пришедшие ему на смену «Минувшие годы» были закрыты правительством. В. И. Семевского не оставляет мечта возглавить собственный исторический журнал по примеру своего старшего брата. Эта мечта смогла осуществиться только в 1913 году, когда начал выходить их совместный с С. П. Мельгуновым ежемесячник «Голос минувшего». Журнал этот оставил заметный след в отечественной историографии, правда Василию Ивановичу удалось в нём потрудиться немоногим более двух с половиной лет — осенью 1916 года он умирает.