Время от времени игроку предстоит делать выбор из нескольких вариантов. В такие моменты игра приостанавливается, и в зависимости от принятого решения сюжет будет развиваться в определённом направлении. Всего имеется 4 сюжетных линии для каждой из 4 героинь. Для просмотра всей истории игру необходимо переиграть несколько раз, принимая различные решения на одном и том же моменте. В случае принятия игроком неверных решений игра заканчивается досрочно.

Для игры Ef компания Minori сделала попытку создать подобие кинофильма — в романе было использовано множество двумерных рисунков, которые представлены с различных ракурсов. Вместо прямого отображения персонажа в центре фонового экрана изображения персонажей в Ef отдалены от центра и появляются ближе к возникновению на экране «событийного» электронного рисунка (CG). Такие рисунки появляются только в определённые сюжетные моменты; они более детализованы и насыщены по сравнению с остальными.

Сюжет

История Ef: A Fairy Tale of the Two поделена на две части. Первая часть под названием Ef: The First Tale включает в себя сюжетные линии Хиро Хироно, Мияко Миямуры, Кёсукэ Цуцуми, Кэй Синдо и Юко Амамии. Она состоит из пролога и двух основных глав, главной героиней первой главы выступает Мияко, во второй главной героиней является Кэй. Вторая часть истории Ef: The Latter Tale повествует о Рэйдзи Асо, Тихиро Синдо, Сюити Кудзэ, Мидзуки Хаяме и Ю Химуре. История включает в себя две главы и эпилог, основными персонажами выступают Тихиро и Мидзуки (в третьей и четвёртой главах соответственно). Вместе эти две части образуют всеобъемлющий сюжет романа Ef: A Fairy Tale of the Two. История разворачивается в городе 音羽.

Ef: The First Tale

Пролог

Юко Амамия, таинственная девушка, одетая как монахиня, и Ю Химура, таинственный джентльмен, появляющийся в церкви, встречаются в церкви во время Рождества. Несмотря на одежду, Юко не имеет никакого отношения к церкви. Она всегда появляется из ниоткуда, чтобы поговорить с Хиро или другими персонажами и дать им совет, и также быстро исчезает. Юко и Ю вместе вспоминают о событиях, произошедших в прошлом году приблизительно в то же время, когда начинается первая глава истории. Юко намекает на то, что всё произошедшее было разъяснено в Ef: A Fairy Tale of the Two. После завершения первой и второй глав вновь показывается разговор между Юко и Ю; Юко завершает свой рассказ о событиях главы (первой и второй) и вспоминает, что ей нужно поговорить с Хиро, Кёсукэ и их друзьями. В конце разговора упоминается продолжение истории, Ef: The Latter Tale.

Первая глава

Протагонист первой главы, школьник Хиро Хироно является профессиональным мангакой несмотря на юный возраст. Из-за большого объёма работы он часто пропускает занятия в школе и тратит много времени на рисование сёдзё-манги; его псевдоним — Наги Синдо. Он настолько увлекается созданием манги, что теряет интерес к школе и концентрируется только на своей работе. Выполняя её, он надеется получить доход, так как не располагает большим количеством денег. Однажды в Рождественскую ночь мимо Хиро на мотоцикле проносится похититель, а вскоре появляется Мияко Миямура. Она без разрешения берёт мотоцикл Хиро и пускается в погоню за грабителем. В результате мотоцикл главного героя оказывается разбитым, а Мияко на одну ночь остаётся у него дома.

Позднее Хиро вновь встречает Мияко в школе и узнаёт, что она учится в параллельном классе; она тоже нечасто посещает школу, находя её скучной для себя. Мияко — энергичная, и в то же время неординарная личность. Она начинает проявлять интерес к Хиро, проводя много времени вместе с ним. Кэй Синдо, подруга детства Хиро, также испытывает чувства к Хиро, что способствует возникновению любовного треугольника между ними тремя. Кэй недовольна тем, что Хиро много времени проводит с Мияко. В конце концов Хиро и Мияко становятся парой.