Возвращение Garden of Delight на сцену сопровождалось новым европейским туром и выступлениями на крупных готических фестивалях. Коллектив два года подряд (в 2000 и 2001) появлялся на Wave Gothic Treffen и должен был выступить на Castle Party VIII (2001) в качестве одного из хэдлайнеров, однако из-за крайне плохой погоды музыканты не смогли выйти к публике. В последующие годы Garden of Delight ещё раз выступили на WGT и дважды стали хэдлайнерами Castle Party, а также приняли участие в нескольких других европейских фестивалях.

Начиная с 2003 года группа возвращается к практике создания концептуальных альбомов, но теперь работает в жанре готик-метал. Музыка GOD стала тяжелее, с каждым годом склоняясь к усилению электронного звучания.

В 2003 году вышел концептуальный альбом Apocryphal, навеянный библейской историей и разбитый на две части — Apocryphal I: The Fallen и Apocryphal II: The Faithful. «В довесок» к ним вышли сингл «Moments» и роскошно оформленный двойной диск Apocryphal Moments, содержавший редкие материалы и видеоклипы. На этих дисках Garden of Delight выступили как блестящие мастера готик-рока и готик-метала, но вершиной их успеха стала трилогия Lutherion, побившая все рекорды продаж для группы.

Альбом Lutherion I (2005) стал, наверное, наиболее тяжёлым и агрессивным по звучанию для коллектива, в музыкальном плане даже отчасти приближаясь к стилю индастриал-метал, а с коммерческой точки зрения — наиболее успешным. Томас Клаузен из немецкого музыкального журнала Sonic Seducer высоко оценил этот диск, в своей рецензии назвав музыку Garden of Delight «крайне волнующей и современной», а сам коллектив — «одним из столпов немецкой готической сцены». В дополнение к альбому вышел второй диск с бисайдами и ремиксами. По той же схеме был организован выпущенный в 2006 году Lutherion II. Завершил трилогию концептуальный альбом Featuring Lutherion III (2007), на котором музыканты, вдохновлённые литературой и фильмами ужасов, использовали в каждой песне различные наводящие на подобные ассоциации семплы — прерывистое дыхание спящих, крики ночных птиц, звук шагов, «замогильные» голоса и т. д.. Из-за сильной антихристианской направленности некоторых текстов все альбомы трилогии издавались в Европе с пометкой Parental Advisory на обложках.

Последней студийной работой Garden of Delight стал альбом Darkest Hour, увидевший свет в 2007 году. Darkest Hour был заметно более меланхоличным и унылым по звучанию, нежели трилогия Lutherion, а в лирике, помимо оккультных мотивов, появились темы депрессии, бренности бытия и апокалиптические мотивы. В буклете к альбому Артауд Сет заявил об окончательном распаде группы и назвал точную дату «кончины» Garden of Delight: 1 ноября 2008 года. Выпустив двойной ретроспективный диск In Memoriam и завершив турне в его поддержку, группа Garden of Delight перестала существовать. Прощальный концерт в Берлине был записан на DVD и издан под названием Last Concert.

После распада

В 2009 году Артауд Сет объявил о том, что реорганизовывает GOD под другим названием и с незначительными изменениями в составе (из квартета группа превратилась в трио). История Garden of Delight официально завершилась, но фактически члены коллектива продолжили совместную работу в том же стиле, что и раньше, в группах Lutherion (названной в честь наиболее известной трилогии GOD) и Merciful Nuns. Позднее последовало ещё одно заявление Артауда Сета, согласно которому «единственной полноправной наследницей Garden Of Delight» является группа Merciful Nuns, в настоящее время исполняющая готик-рок в духе ранних Sisters of Mercy и поздних Joy Division. Спустя три года после распада Garden of Delight, в 2012 году, на лейбле Solar Lodge вышло переиздание наиболее известного студийного альбома коллектива под названием Necromanteion IV (Rediscovered).