Из Штаба Номаду сообщают о том, что правительство США имеет виды на этот остров и чтобы тот пробирался в точку эвакуации, где его подберёт VTOL ({{lang-en|Vertical Take-Off and Landing}} — Самолёт вертикального взлёта и посадки). Номад должен присоединиться к операции «вторжения» на остров.

Assault (Штурм)

На борту VTOL’а Номад встречается с Психом, уже доставившим заложницу на «Конституцию».

Вторжение армии США проходит не самым лучшим образом, однако вовремя скоординировав действия основных сил со спецгруппой «Хищник», им всё же удаётся занять гавань и потопить корейский крейсер. На VTOL’ах прибывают основные силы вторжения и бронетехника вместе с майором Стриклэндом. Психу Стриклэнд даёт особое задание и отправляет его в помощь группе Альфа.

Onslaught (Наступление)

Американские войска при поддержке бронетехники и авиации прорываются к подножью горы, где располагается штаб войск КНДР, генерал Кхон и сам «Храм». Добравшись почти к самому подножью горы, Номад замечает, как в гору начали бить молнии, сопровождаемые сильными подземными толчками, частичным обрушением горной породы и неестественными механическими звуками. Из самой горы несколько раз вылетают роботы и атакуют корейцев.

Awakening (Пробуждение)

Основные войска отстают от Номада, посему в шахты, ведущие к «Храму», он спускается один, а небольшой отряд десантников остаётся охранять вход. У самого «Храма» Номад попадается в ловушку к корейскому спецназу в нанокостюмах и лично генералу Кхону. Тот уже догадался, что это не просто храм, а нечто большее — «нескончаемый источник энергии», как он полагает; и он не допустит, чтобы этот источник достался американцам. Кхон заставляет оставшихся членов экспедиции, среди которых есть и Елена Розенталь, начать цепную реакцию, способную запустить «храм/источник». Толчком к такой реакции должен послужить направленный взрыв тактического заряда у входа в «храм\источник». Елена уговаривает Кхона не делать этого, но тщетно, — заряд взрывают. Начинаются сильные электромагнитные возмущения, в результате которых погибают все, кроме Елены, Номада и Кхона, которого Номад впоследствии убивает. Начавшаяся реакция приводит в движение всю толщу горы, и пещера с «храмом» начинает обрушиваться. Елену всё же успевает подобрать вовремя прилетевший VTOL, а Номада заваливает. Оправившись, он решает продвигаться вглубь горы через образовавшийся в «Храме» проход.

Core (Ядро)

Вскоре Номад понимает, что это был вовсе никакой не «храм», и не «нескончаемый источник энергии», а корабль пришельцев, внутри которого не действует гравитация и царит очень низкая температура, около −200 °F (-129 ° С). Там он встречает желеподобных инопланетян с весьма специфическим строением тела и манерой передвижения (отсутствие гравитации напрямую повлияло на их развитие). Путешествуя по кораблю, он записывает всё на встроенную в костюм аудиовидеокамеру и собирает немало полезных сведений, в частности о готовящемся вторжении инопланетян. Оно начинается, когда Номад уже находится у самого выхода.

Уровень «Core» был включён русскоязычным игровым журналом «Игромания» в десятку лучших игровых моментов 2007 года и занял в списке третье место, уступив первые два места моментам из игр Call of Duty 4 и BioShock. Журналисты так прокомментировали данный уровень: «Вот уже три часа вы носитесь по sandbox-джунглям, всё это начинает изрядно утомлять. И тут игра неожиданно помещает вас внутрь огромной скалы, которая на самом деле никакая не скала, а база пришельцев. Где к тому же не работает гравитация. Два часа чистого концентрированного восторга».